Индивидуальный список баз находится в файле: %appdata%\1C\1CEStart\ibases.v8i

Это обычный текстовый файл, примерное содержание такое:

[ИмяБазы1С]
Connect=File="C:\1CBases\ИмяБазы1С";
ID=356c1d2f-2553-4c30-a594-d0f4c644e071
OrderInList=16384
Folder=/
OrderInTree=256
External=1
ClientConnectionSpeed=Normal
App=Auto
WA=1
Version=8.3
DisableLocalSpeechToText=0

Для того, чтобы сделать один список баз для всех пользователей терминального сервера. Подготавливаем его, т.е. наполняем его списком баз. Копируем его в доступное для всех пользователей место. Например,

c:\Users\Public\bases\ibases.v8i

у всех пользователей должны быть полные права на этот файл.

Далее редактируем файл, c:\ProgramData\1C\1CEStart\1cestart.cfg

InstalledLocation=C:\Program Files (x86)\1cv8
CommonInfoBases=c:\Users\Public\bases\ibases.v8i
InstallComponents=DESIGNERALLCLIENTS=1 THINCLIENTFILE=0 THINCLIENT=0 WEBSERVEREXT=0 SERVER=0 CONFREPOSSERVER=0 CONVERTER77=0 SERVERCLIENT=0 ADMINISTRATIONFUNC=0 COPYTHINCLIENTDST=0 LANGUAGES=RU

Добавили, вторую строчку.

Все.